通常情况下金针菇发酵了是不建议食用的，金针菇存放的时间比较短，如果存储不当导致金针菇出现发粘、变黄以及斑点、异味等腐烂变质的情况，说明已经发生变质，其中会有大量的细菌滋生现象，如果误食可能会引起头痛、头晕、恶心、呕吐、腹泻以及发热等不适的症状，特别是对于自身有肠炎、胃炎等患有胃肠疾病的患者，进食后可能会导致病情加重，所以是不建议食用的。
金针菇属于菌类的食物，其中含有丰富的蛋白质、氨基酸、脂肪、碳水化合物以及膳食纤维素等，适当地食用能够促进排便，对于减肥有一定的作用，营养价值比较高，但是存放时间较短。在平时建议将未食用完的金针菇建议存放在温度较低的环境中，可以延长保存时间，避免出现变质、腐烂的现象。