两个月宝宝睡着嘴巴吧唧吧唧，可能是由于大脑神经发育不完善、饥饿或者缺钙等原因导致的，可以通过一般治疗和药物治疗的方法进行改善。
1、大脑神经发育不完善：由于宝宝年龄比较小，大脑神经皮层发育不完善，所以在夜间睡觉时会出现翻身、身体抖动、蹬腿、吧唧嘴等现象，通常情况下随着年龄的增长，大脑神经发育完善后，症状会自行恢复。
2、饥饿：两个月宝宝睡着嘴巴吧唧吧唧可能是由于饥饿导致的，通常情况下还会引起哭闹，如果是由于饥饿导致的哭闹，在及时给宝宝进行喂养后，宝宝睡着嘴巴吧唧吧唧的现象可逐渐改善。
3、缺钙：由于宝宝正处于生长发育时期，如果身体缺乏钙质会导致出现多汗、哭闹、易惊醒、枕秃等症状，可以在医生的指导下给宝宝补充钙，比如小孩碳酸钙D3颗粒、葡萄糖酸钙口服溶液等，能够缓解症状。