3个月宝宝晚上睡觉哼哼唧唧可能是由于环境因素、缺钙等导致，可通过调整环境、服用药物缓解症状。
1、环境因素。三个月宝宝晚上睡觉哼哼唧唧，可能是由于环境因素导致，通常和宝宝睡觉房间温度过高或过低、盖得被子较厚、衣着较厚等有关，宝宝睡眠温度不合适，影响到正常的睡眠，会通过哼哼唧唧的方式来表达，家长应当观察宝宝的反应，根据宝宝的反应适当调整所处环境温度、适当增加减少衣物、更换被子等，让宝宝处于舒适的环境中睡觉，可有效缓解睡觉哼哼唧唧的现象。
2、缺钙。三个月宝宝晚上睡觉哼哼唧唧，可能是由于缺钙导致，缺钙会使宝宝大脑神经处于兴奋的状态，从而出现入睡困难、睡眠不稳、多汗、容易惊醒、磨牙等症状，家长可在医生的指导下给宝宝服用碳酸钙D3颗粒、葡萄糖酸钙口服溶液、醋酸钙片等药物进行治疗。