N95口罩和医用外科口罩，一般都可以起到比较好的阻碍细菌入侵的作用，但总体方面来讲，N95口罩的密封性会较好些，而医用外科口罩，通常级别较低，但这两种都属于符合微生物隔离标准的口罩类型。
N95口罩执行的属于美国口罩的标准，要求直径在0.3μm以上的颗粒的滤过效率达到95%以上，所以对于普通的病毒和细菌，都能够起到防御的作用。而普通医用外科口罩，通常级别是比较低的，尤其对于预防新型冠状病毒，要求佩戴的口罩应该是医用的外科口罩，至少能够预防空气当中3μm以上的颗粒，所以对于大部分的细菌及病毒也能够起到过滤效果。无论是N95口罩和医用外科口罩，都是符合病原微生物隔离标准的，建议要正确的佩戴口罩，并且在超过4小时以上时还要及时地更换，防止受到细菌和病毒侵扰。