酸奶菠萝一起吃并不会对人体造成较为严重的危害，可以适量食用，但不建议过量食用。适量食用酸奶和菠萝，能够对人体起到补充营养、促进消化等作用，酸奶中含有较为丰富的蛋白质、脂肪、碳水化合物等营养物质，也含有一定量的钙、磷、钾、锌等微量元素，菠萝中含有一定的粗纤维、碳水化合物、蛋白质、维生素等营养物质以及锰、铜、钾、镁等微量元素，适量食用酸奶和菠萝，能够补充人体所需的营养物质以及微量元素，也可以对提高免疫力起到一定的帮助。
如果过量食用酸奶和菠萝，可能会加重肠胃蠕动的负担，对肠胃产生一定的刺激，引起肠胃不适感，如腹胀、腹痛、腹泻等不适症状。长时间食用菠萝和酸奶，通常会导致机体内摄入的营养物质不足，容易引起营养不良的现象。