乳糖不耐受通常情况下是不可以直接吃水解蛋白奶粉的，因为在水解蛋白奶粉中还存有一定量的乳糖，在喝了之后会对人体的肠胃产生刺激，造成不良的影响。乳糖不耐受主要是由于胃肠道内消化乳糖的乳糖酶出现不足引起的，乳糖酶不足是因为患者的乳糖缺乏或者缺失、乳糖酶活性降低等因素导致的，一旦乳糖酶不足，进入肠道内的乳糖没有办法被完全消化、吸收以及利用，剩下的乳糖在被细菌异常发酵后产生大量的气体，进而导致腹胀、肠胀气等不良症状。
由于水解蛋白奶粉中仍然存在乳糖的成分，因此，不可以让乳糖不耐受的宝宝直接食用水解蛋白奶粉，在食用水解蛋白奶粉之前，应先加入乳糖酶，分解适度的水解蛋白奶粉后，再让宝宝食用，如果在食用后还是出现了不适的症状，及时在医生的指导下使用药物治疗，常见的有双歧杆菌三联活菌胶囊、乳糖酶片等。