小孩高烧39.6℃，可能是由于上呼吸道感染或肺炎等因素引起的，可在医生的指导下使用药物进行治疗。
1、上呼吸道感染。上呼吸道感染是鼻腔、咽部、喉部急性炎症的总称，大部分是由于呼吸道合胞病毒、腺病毒等病毒感染引起的，通常会有高烧、咳嗽、咽干、咽痛、流鼻涕、鼻塞等症状。可在医生的指导下使用对乙酰氨基酚泡腾颗粒、小儿氨酚黄那敏颗粒、阿昔洛韦颗粒等药物进行治疗。
2、肺炎。肺炎是指肺组织的炎症和肿胀反应，大部分是由于细菌、病毒、支原体等病原微生物感染肺组织引起的，通常会有高烧、咳嗽、咳痰、咽干、咽痛等症状，可在医生的指导下使用小儿柴桂退热颗粒、小儿清热利肺口服液、小儿麻甘颗粒等药物进行治疗，以缓解小孩高烧的症状。