一般情况下，肚脐中心按压疼一按肚子里面有水可能是脐炎、肠胃炎等疾病所导致的，患者在患病后应当及时前往医院，在医生的指导下通过应用药物、改善生活习惯等方式进行治疗。
1、脐炎
发生脐炎多半是由于没有注意脐部卫生，有时会用手去扣肚脐，或太久没有清洗到脐部，导致产生细菌而引发炎症。患者应养成良好的生活习惯，避免搔抓肚脐眼等不良习惯，也可以在清洗脐部后，在医生指导下使用碘伏消毒液或3%过氧化氢消毒液进行消毒，然后涂抹莫匹罗星软膏、红霉素软膏等消炎药物。
2、肠胃炎
通常是因为大肠埃希菌感染、轮状病毒感染所导致的，患者会伴有腹泻、恶心、呕吐等症状，因此肚脐中心按压疼一按肚子里面有水可能是由于肠胃所导致的。患者平时应该保证规律的饮食，注意饮食的卫生，避免食用辛辣刺激的食物，同时患者应当在医生指导下使用抗病毒的药物治疗，如诺氟沙星胶囊、蒙脱石散等。