早上醒来，下腹不舒服，浑身大汗是由于克罗恩病、假膜性肠炎等原因引起的，出现上述问题后需要通过药物以及调整饮食结构的方式进行治疗。
1.克罗恩病
克罗恩病是由于遗传因素、肠道功能受损等因素引起的。克罗恩病患者可能出现早上醒来，下腹不舒服，浑身大汗、腹泻等症状。出现克罗恩病需要及时就医，并在医生指导下使用柳氮磺胺吡啶肠溶片、硫唑嘌呤片等药物进行治疗。
2.假膜性肠炎
假膜性肠炎是由于大量使用抗生素、长期服用免疫抑制剂等原因引起的。假膜性肠炎患者可能会出现腹部痉挛性疼痛，突发性腹泻、腹胀等症状，导致患者早上醒来，下腹不舒服，浑身大汗。患者可以在医生指导下使用注射用盐酸万古霉素、甲硝唑片等药物进行治疗。患者在出现腹胀腹泻时，在饮食方面需要注意进食容易消化的食物，避免增强肠胃负担。