通常情况下，吃了药睡觉起来嘴巴苦是由药物刺激、肝火旺盛等引起的，可以应用药物、日常护理等方法进行治疗。
1.药物刺激
有部分药物中含有苦参、苦黄连等成分，会刺激味蕾，产生苦味，会出现吃了药睡觉起来嘴巴苦的情况，这是一种正常现象，不需要进行特殊治疗。患者在吃药后口苦，可以通过漱口刷牙、吃甜食来缓解，需要注意避免吃冰冷食物，降低药物效果。
2.肝火旺盛
肝火旺盛是由不规律饮食、不良情绪等因素引起的，伴随着口苦、头晕等症状，患者在吃药后，会因肝火旺盛导致胆汁反流，从而出现吃了药睡觉起来嘴巴苦的情况，可以在医生的指导下服用龙胆泻肝丸、清肝利胆口服液等药物进行治疗。患者在日常生活中，要注意饮食规律，一日三餐按时吃，要保持良好的睡眠质量，不要熬夜，可以适当进行体育锻炼，增加抵抗力。