通常眼睛里有小白虫可能是由于结膜炎、眼囊虫病等原因导致，患者一般可以通过使用药物、养成良好的用眼习惯等方式进行治疗。
1、结膜炎
通常结膜炎是由于病毒感染、细菌感染等原因引起，常伴有眼部分泌物异常增多、眼睑水肿等症状，所以可能造成眼睛里有小白虫的现象。患者通常可以通过在医生指导下使用药物等方式进行治疗，如阿昔洛韦滴眼剂、更昔洛韦滴眼液等，此外患者应注意眼部卫生，不要用手或不洁的毛巾揉眼睛。
2、眼囊虫病
通常眼囊虫病是由于囊尾蚴感染、饮食不洁等原因引起，可在眼部玻璃体、视网膜等部位观察到数量不等的浅灰白色异物，所以可能造成眼睛里有小白虫的现象。患者通常需要遵循医嘱应用阿苯达唑颗粒、诺氟沙星胶囊等药物进行治疗，此外患者应注意食品卫生的问题，尽量避免食用野生动物，以免再次患上该种疾病。