一般情况下，长期服用2型糖尿病药物可能会造成胃肠道损害、肝肾功能损害等危害，因此糖尿病患者应定期到医院进行复查，并在医生的指导下合理应用药物，避免对身体的危害加重。
1.胃肠道损害
2型糖尿病药物容易引起消化不良，常见的副作用有恶心、呕吐、腹泻等胃肠道症状，当降糖药物经过肠道时，会刺激肠道分泌激素，因此可能会对肠道菌群的结构造成影响。患者应在医生的指导下，从小剂量开始用药，等机体适应后再逐渐增加用量，避免造成严重的胃肠道不适。
2.肝肾功能损害
有些2型糖尿病药物会通过肝脏或肾脏进行代谢，因此如果肝肾功能障碍患者使用这类药物，可能会导致药物无法排出，从而产生肝肾功能损害。患者在用药前应检查肝肾功能，存在肝肾疾病的患者应遵医嘱更换药物。