通常情况下，甲状腺和肾挂什么科室要根据疾病的类型判断，一般可以选择内分泌科、乳甲外科、肾内科等，建议患者根据自身情况就医。
1.内分泌科
主要治疗内分泌疾病和代谢类疾病，甲状腺方面的疾病如甲亢、甲减是由内分泌引起的，属于内分泌疾病，所以可以选择内分泌科，如果是由于甲亢引起的肾损害也是需要挂内分泌科。
2.乳甲外科
主要治疗乳腺疾病、甲状腺疾病和两者旁边器官的疾病，如果是甲状腺出现结节等外科疾病，则属于乳甲外科的范畴，需要挂乳甲外科。
3.肾内科
肾内科主要检查项目有血常规、尿常规、肾功能、肾脏彩超等，肾涉及的疾病比较多，需要根据具体的疾病选择就诊科室，如肾炎、尿毒症等疾病需要内科进行治疗，就可以选择在肾内科就诊。
除了以上科室之外，甲状腺和肾还可以挂普外科。