通常情况下，睡醒第二天眼睛发炎感觉有异物可能是由于结膜炎、干眼症等原因所导致的，患者一般可以在医生的指导下通过应用药物、手术等方式进行治疗。
1.结膜炎
通常结膜炎是由于受到病原微生物、外物刺激等原因引起的，患者常伴有分泌物增多、畏光等症状，此外部分患者也可能会出现早晨起床眼睛感觉有异物的现象。建议患者应当遵循医嘱应用阿昔洛韦滴眼液、妥布霉素滴眼液等药物进行治疗。
2.干眼症
通常干眼症是由于患者长时间用眼导致泪腺功能异常，患者常伴有眼睛干涩、灼热等症状，也可能会出现睡醒第二天眼睛发炎感觉有异物的现象。患者应该立即去医院进行检查治疗，一般可以在医生的指导下应用玻璃酸钠滴眼液、右旋糖酐羟丙甲纤维素滴眼液等药物治疗，如果病情严重，需要考虑手术治疗，比如自体颌下腺移植、泪小点封闭术等。