通常六个月宝宝睡觉总爱摇头可能由于头皮不适、缺乏维生素D等原因引起的，建议通过改善头部不适症状，应用药物进行治疗。
1.头皮不适
宝宝出生后免疫系统发育还不完善，抵抗力比较弱，头面部、后枕部因为汗渍等各种原因容易出现湿疹或者其他的过敏性皮疹，这些都会导致头皮瘙痒，会让宝宝非常的难受，宝宝不能正常表达出来，就会出现睡觉的时候摇头的现象，通过摇头来缓解自己头皮瘙痒的症状。建议在医生的指导下通过应用氢化可的松乳膏、氧化锌软膏等药物进行治疗。家长保持宝宝头皮清洁干燥，减少宝宝不适。
2.缺乏维生素D
宝宝如果在生长发育过程中缺乏维生素D，会出现大脑皮层兴奋性增高，从而引起睡觉总爱摇头的现象。这需要家长及时带宝宝去医院就诊，检查是否有维生素D的缺乏，明确病因后可以在医生指导下给予维生素D滴剂、龙牡壮骨颗粒等药物进行治疗。家长可以在天气比较好时，经常带宝宝外出晒太阳，这对补充维生素D会有很大帮助。