一般情况下，结膜炎眼球上有水疱可能是由结膜炎、淋巴管堵塞等原因导致的。患者可以在医生指导下通过应用药物、改善生活习惯等方式进行治疗。结膜炎眼球上有水疱也有可能是其他原因导致的，建议患者及时去医院进行检查，明确病因后进行治疗，避免出现不良影响。
1、结膜炎
通常结膜炎可能是由细菌感染、病毒感染、过敏反应导致的。患者会出现眼睛红肿、瘙痒、疼痛的症状，有的患者眼球上还会长水疱，所以患者会出现结膜炎眼球上有水疱的现象。一般建议患者应用抗生素眼药水如盐酸左氧氟沙星滴眼液、红霉素滴眼液等进行治疗。同时患者需要注意多休息，合理用眼，避免长时间看书和使用手机、电脑等电子产品，也可通过做眼保健操的方式促进眼部肌肉的放松，帮助缓解症状。
2、淋巴管堵塞
通常眼睛淋巴管堵塞是由长期炎症刺激、眼部频繁化妆导致的。患者会出现球结膜大疱或珠状体局部隆起等症状，还会伴有眼部充血、分泌物增多等现象，还可能会伴有明显异物感、疼痛等不适感，所以患者会出现结膜炎眼球上有水疱的现象。一般可在医生指导下进行穿刺治疗、手术切除治疗等手术来治疗。