一般来说，跑步停下来小腿骨头疼，可能是骨头肌肉劳损、骨质疏松等因素造成的，可应用药物治疗。建议患者应及时改正生活习惯，避免剧烈运动，积极注意休息等。
1.骨头肌肉劳损：主要是患者长时间大量的运动，劳累过度，引起了骨头肌肉处的损伤，产生无菌性炎症，炎性因子刺激小腿骨头，产生疼痛。建议患者在医生的指导下应用双氯芬酸钠缓释片、洛索洛芬钠胶囊等进行治疗。
2.骨质疏松：主要是患者长期的不健康的生活方式、缺钙等因素，导致骨密度下降，出现骨质疏松，主要表现为运动之后肌肉、关节处的乏力、疼痛感等。建议患者在医生的指导下应用骨康胶囊、碳酸钙胶囊等进行治疗。