通常眼睛晚上刺痛流泪可能是由于慢性结膜炎、干眼症等原因导致，一般可以通过应用药物、进行手术等方式进行治疗。
1、慢性结膜炎
通常慢性结膜炎是由于急性结膜炎没有彻底治疗、长期接触某些刺激性物体或气味等原因引起，常伴有眼睛发红、干涩、疼痛、异物感等症状，所以可能眼睛晚上刺痛流泪的现象。一般可在医生指导下应用盐酸左氧氟沙星滴眼液、氯霉素滴眼液等药物进行治疗。
2、干眼症
通常干眼症是由于眼泪成分失衡、长期身处外界空气干燥或吸烟的环境等原因引起，常伴有眼部疲劳、酸胀、异物感的症状，眼睛时常会出现刺痛，灼痛或刮擦的感觉。也可能造成眼睛晚上刺痛流泪的状况。一般症状轻微者可在医生指导下，应用硝酸毛果芸香碱滴眼液、盐酸溴己新片等药物进行治疗。症状严重者则在医生考虑下是否需要进行自体颌下腺移植、泪小点封闭术等手术进行治疗。