跑完一千两条腿非常酸痛一般情况下可能是由于过度劳累、肌肉拉伤、肌炎等因素造成的。建议患者跑完后好好休息，按摩一下腿部，用温水泡脚缓解酸痛。
1.过度劳累：由于进行剧烈的体育运动，肌肉过度收缩就会导致乳酸堆积不能及时分解，会刺激肌肉内中的神经造成酸痛，建议患者在医生的指导下应用云南白药膏，活血止痛膏治疗。
2.肌肉拉伤：可能是在剧烈运动后，肌肉舒张过的不小心造成损伤，肌肉内血管和神经受损，造成疼痛，建议患者静养一段时间，好好休息，适当按摩缓解疼痛。
3.肌炎：一般情况下剧烈运动后，肌肉血液循环过快导致发炎，白细胞和积液增多，压迫神经造成疼痛。建议在医生指导下应用布洛芬缓释胶囊、阿司匹林肠溶片、萘普生胶囊等消炎镇痛药物。