通常情况下，舌头根部长黑色毛可能是由于根毛菌感染、药物等原因导致的，可通过使用药物、改善习惯等方式进行治疗。
1.根毛菌感染：口腔环境过差、长期吸烟等原因可能会导致黑色根毛菌感染，致使口腔中丝状乳头变黑。平日应当注意每日刷牙，可用牙刷轻轻刷舌头上黑色的部分，饭后漱口，戒烟戒酒，保持口腔的清洁卫生。可遵医嘱使用溶菌酶含片、醋酸氯己定溶液等药物进行治疗。
2.药物：米诺环素、四环素等药物均可能会引起舌根丝状乳头变黑，从而可能导致舌头根部长黑色毛。建议患者及时停药，避免情况更加严重。在日常生活中保持口腔的清洁卫生，饭前饭后及时刷牙。