一般情况下，肚脐眼每天半夜疼可能是由于腹部受凉、肠胃功能紊乱或阑尾炎等原因引起。通常可以通过应用药物、调整生活方式或手术治疗等方式进行治疗。当患者出现肚脐眼每天半夜疼的现象时，应及时就医，遵医嘱进行治疗。
1.腹部受凉：可能由于夜间室温过低或晚餐食物过凉，腹部受到刺激，导致胃肠道不适，患者可能出现脐周疼痛，或伴随腹泻等症状。建议患者在日常生活中改善生活习惯，注意保暖，提高自身免疫力。
2.肠胃功能紊乱：通常由于患者晚间过度的饮食导致肠功能紊乱，患者可能会出现腹痛、腹泻等症状。在医生指导下，患者可以通过应用乳酶生片、健胃消食片、罗红霉素胶囊或阿奇霉素片等药物进行治疗。
3.阑尾炎：通常可能由于淋巴滤泡的增生、食物残渣堵塞或细菌感染等因素导致的，患者可能会出现下腹疼痛、慢性疼痛等症状。在医生指导下，患者可以通过应用头孢拉定胶囊、阿莫西林胶囊等药物进行治疗，疼痛严重的急症需要在医生指导下及时进行阑尾切除术。