通常吃了两个疗程的阿奇霉素还是咳嗽，是由于身体对阿奇霉素产生了耐药性或病毒感染导致的，建议患者和医生进行沟通，立即停药或换药治疗，同时注意改善生活习惯进行调理。
1.身体产生耐药性：通常身体对阿奇霉素产生耐药性是因为长期滥用抗生素导致的，一旦产生耐药性，阿奇霉素便难以发挥药效，所以有可能出现吃了两个疗程的阿奇霉素还是咳嗽的现象，建议患者及时就医，根据医生诊断及指导换用药物治疗，如川贝枇杷露、复方鲜竹沥口服液等。
2.病毒感染：阿奇霉素是一种抗生素，主要针对敏感细菌及支原体、衣原体等引起的感染，对于病毒感染则完全没有作用，吃了两个疗程的阿奇霉素还是咳嗽可能是因为病症是由于病毒感染导致的，建议患者和医生进行沟通，在医生指导下换用抗病毒药物，如磷酸奥司他韦颗粒、盐酸金刚烷胺片等。患者日常还需注意保暖，出门佩戴口罩，避免前往人群聚集处，饮食宜清淡，促进病症的恢复。