拔完智齿第三天牙龈疼可能是由于感染、不良卫生习惯引起的，建议患者在出现症状后及时就医，并在专业医生的治疗下通过改善日常生活习惯、应用药物等方式进行治疗，缓解症状。
1.感染：在拔完智齿第三天后牙龈肿痛可能是由于在拔牙之后拔牙窝内血凝块造成的牙龈肿痛现象。建议患者在出现症状后及时就医，并在专业医生的指导下通过使用碘甘油、阿奇霉素分散片等药物进行治疗，缓解症状。
2.不良卫生习惯：如果患者在拔完智齿第三天后没有对口腔进行清洁，可能会由于食物残渣残留导致出现牙龈疼的现象。建议患者在日常生活中养成良好的卫生习惯，定期对口腔进行清洗。养成早晚刷牙，饭后漱口的习惯。