三个月小孩睡觉一惊一惊的可能是睡眠环境、缺乏维生素D和钙等原因导致的，可以通过一般治疗、药物治疗等方式进行治疗。并建议及时就医，在医生指导下进行相应处理。
1.睡眠环境：睡眠环境温度太冷或太热或者室内光线太亮、太嘈杂都会影响小孩的睡眠质量，从而出现三个月小孩睡觉一惊一惊的表现，建议家长适当调整室内温度、光线以及噪音等方面进行改善。
2.缺乏维生素D和钙：当小孩缺乏维生素D和钙时，会导致大脑皮层过于兴奋，会出现三个月小孩睡觉一惊一惊的，且伴有汗多、哭闹、枕秃等症状。可在医生的指导下使用乳酸钙、碳酸钙和维生素D滴剂等药物进行治疗。