三个月婴儿入睡困难容易醒，可能由于生活不规律、神经系统发育不完全、缺乏微量元素等导致。可以通过一般治疗、药物治疗等方式缓解。
1.生活不规律：如果三个月婴儿黑白颠倒，白天大部分时间在睡觉，那么晚上入睡是存在困难的。此时应注意生活规律，尽量减少白天睡眠的时间，合理安排睡眠时间。
2.神经系统发育不完善：三个月婴儿仍处于发育时期，神经中枢发育不完全，因此对环境条件十分敏感，这是正常的生理性现象导致的。一般不需进行特殊治疗，睡眠时注意保暖，避免着凉即可。
3.缺乏微量元素：如果三个月婴儿缺乏微量元素，其钙磷代谢将会不稳定，还可能影响到其神经系统的发育，因此睡眠难、易惊醒。可以在医生建议下补充鱼肝油、赖氨葡锌颗粒、葡萄糖酸锌片等。