一般情况下，三岁孩子反复细菌感染发烧可能是急性呼吸道感染、急性胃肠炎、扁桃体发炎等原因导致的。一般可通过物理降温、药物治疗等方式进行治疗。
1.急性呼吸道感染：三岁孩子反复细菌感染发烧，考虑可能是急性呼吸道感染所致，同时可能伴随咳嗽、咽痛等呼吸道症状。注意观察孩子的体温情况，发热时可采用温热毛巾擦拭身体、冷敷等方式进行物理降温。
2.急性胃肠炎：细菌感染发烧可能是急性胃肠炎导致，需要通过大便常规等检查明确诊断，在医生指导下应用药物治疗，比如阿奇霉素片、硫酸庆大霉素片、西咪替丁片等。
3.扁桃体发炎：孩子反复细菌感染出现发烧，可能是扁桃体发炎引起的，孩子的免疫力降低时，容易出现扁桃体发炎而导致出现反复发烧的情况。可在医生指导下使用阿莫西林胶囊、头孢丙烯片、青霉素V钾片等药物进行治疗。