早上起来刷了牙还是有口臭，这可能是口腔卫生不佳、慢性胃炎等疾病导致，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，并且生活中需要养成良好的生活习惯进行调节。
1.口腔卫生不佳：晚上刷牙时口腔中可能残留食物残渣，细菌分解后可能产生异味，导致早上起来刷了牙还是会有口臭。平时应保持口腔内部的清洁，养成饭后漱口的好习惯。
2.慢性胃炎：由于患者平时饮食不注意或者胃炎长期没有得到有效的治愈，就可能会导致慢性胃炎的现象，患者通常表现为上腹部不适、食欲不佳、口臭等情况。建议患者在医生的指导下使用奥美拉唑肠溶片、阿莫西林胶囊等药物进行治疗。