月经十几天不干净腰疼可能是由于盆腔炎、节育环异位等原因导致，可以遵医嘱应用药物、取出节育环等方式进行治疗。
1、盆腔炎：当盆腔有炎症时就会造成子宫内膜脱落不干净，引起月经延长和腰痛的现象出现。同时如果不及时治疗炎症累积到卵巢的时候，就会造成卵巢功能出现问题，也会有腰痛的现象出现。一般在医生的指导下可以注射用头孢曲松钠、注射用头孢西丁钠等药物进行治疗，同时注意私处护理，保持干净整洁，防止发生持续感染。
2、节育环异位：有部分女性上节育环当节育环在体内发生错位，就可能会刺激到子宫内膜，从而引起月经异常出血的现象，并且当子宫出现收缩时，就会引起腰疼的现象出现。如果不适症状是节育环异位导致，建议在专业的医生指导下将节育环取掉，同时在饮食上可以多摄入牛奶、鸡蛋等营养比较丰富的食物，避免食用辛辣刺激性食物。