一般情况下，戒烟5天咳嗽特别厉害是一种戒烟反应，也有可能是患者在戒烟期间上呼吸道感染引发的咳嗽，建议患者在医生的指导下通过应用药物进行治疗。
1、戒烟反应：正常情况下，在戒烟后咳嗽考虑是呼吸道黏膜逐渐恢复，吸烟时沉积在呼吸道、肺部等呼吸系统当中的有害物质、细菌等被呼吸道黏膜中的绒毛所吸附并形成痰液，人体在此时会通过咳嗽的方式将痰液咳出，进而导致戒烟5天出现咳嗽特别厉害的情况。
2、上呼吸道感染：患者在戒烟期间可能受到病毒感染可能会引发咳嗽、咽痛、流清水鼻涕等症状，建议患者遵医嘱应用利巴韦林颗粒、磷酸奥司他韦颗粒等药物进行治疗。