通常情况下，活检有什么危害副作用要根据活检的方式来判断。活检方式包括手术切取、内镜下钳夹、穿刺等。可能会有出血、疼痛、感染等危害和副作用。
1.手术切取
主要危害和副作用是出血、疼痛和感染。如开胸活检，手术切取要将可疑的病灶组织进行切除，会出现伤口，造成出血和疼痛，如果伤口护理不当还可能出现感染的情况。
2.穿刺
主要危害和副作用是出血和气胸。如肺穿刺活检，穿刺一般危害较小，如果操作不当扎错可能会有出血现象，穿刺还可能遇见气胸的情况，导致外界气体进入胸腔里，要进行排气治疗。
3.内镜下钳夹
主要危害和副作用可能有出血、穿孔等。如食道活检，内镜插入可能会导致黏膜出现损伤撕裂，而且插镜后会有剧烈呕吐的情况，都可能导致出血，操作动作过猛，可能出现穿孔的情况。