抗原检测是否有疼痛感是根据采样部位和采取方式而定。对于传染性疾病，如果是通过咽喉部分泌物以及尿液取样进行抗原检测，则不会造成患者疼痛。例如在检测新冠病毒抗原时，用抗原检测棉签从鼻咽部采取标本的过程中，仅有可能表现出恶心、呕吐等不适感，基本没有疼痛感。如果是采取抽血检查或者脑脊液检查等方式进行抗原检测，在抽取静脉血和脑脊液的过程中会因对皮肤有直接刺激有轻微的疼痛感，但这种疼痛一般在人的忍受范围之内。
抗原检测一般运用抗原抗体结合反应来对未知抗原进行检测，通常情况下采用血液、咽喉部分泌物、尿液、脑脊液等抗原来进行抗原检测。在抗原检测抽取标本过程中，如果有任何疼痛和不适感，应及时与医生交流。对于因疾病进行抗原检测的病人，需要以抗原检验实际结果为根据，积极与医生沟通疾病治疗方案。