晚上吃完菠萝半夜恶心可能是由于消化不良或急性胃肠道炎导致的，需及时去医院就诊，明确病因后，在医生指导下，采取进一步处理。
1、消化不良：菠萝富含大量的纤维素，若过量食用会导致消化不良，进而产生恶心、腹痛等消化系统反应。可遵医嘱使用促消化道蠕动药物如枸橼酸莫沙必利片、多潘立酮片等促进胃肠道蠕动，改善消化不良症状。
2、急性胃肠道炎：由于食用菠萝导致剧烈腹痛，恶心呕吐等，可能是由于生冷的食物引起胃肠动力紊乱导致急性肠胃炎。需在医生指导下使用甲氧氯普胺片、维生素B6片等药物进行止呕。同时应在日常饮食，注意避免食用过于生冷刺激类的食物。