黑色素瘤的治疗并不存在特效药，但是临床治疗比较有效的药物主要是环磷酰胺、维莫非尼等。对于黑色素瘤的治疗，首选治疗方法就是手术治疗，一旦确诊之后能够手术治疗的，尽量及早手术治疗，术后辅助全身化疗、放疗。但部分黑色素瘤患者病情比较严重，发现的比较晚，不能采取手术治疗，也可以进行靶向药物治疗和免疫药物治疗。
环磷酰胺，是一种常用的化疗药物，这种药物可以在肿瘤细胞内分解出磷酰胺氮芥，和DNA发生烷化，有效的抑制肿瘤细胞的生长繁殖。维莫非尼，对于黑色素瘤有很好的治疗作用，尤其是对经CFDA批准的检测方法确定的BRAFV600突变阳性的不可切除或转移性黑色素瘤有很好的治疗作用，但不能用于治疗BRAF野生型黑色素瘤。