普通肠镜和无痛肠镜的区别在于麻醉方式不同、使用器具不同等。建议患者在选择普通肠镜和无痛肠镜的时候，前往专业医院，明确病因后在医生的指导下进行。
1.麻醉方式不同：无痛肠镜选择的是麻醉状态，而普通肠镜选择的是清醒状态。在进行无痛肠镜的时候，需要注射麻醉药。患者处于睡眠麻醉状态当中，而普通肠镜是患者处于清醒状态，整个操作过程患者都是在清醒中进行的。
2.器具不同：无痛肠镜使用的机械相对比较小，也相对比较精细，患者在整个过程当中不会产生疼痛的感觉，检查之后就可以恢复清醒状态，医患配合程度相对比较好。普通肠镜则是在清醒的状态下使用相对比较大的传统肠镜进入到大肠当中，检查大肠内结构的变化。在检查过程当中，需要通过生理弯曲会产生腹胀、疼痛等感觉。