睡醒就咳嗽可有多方面原因的影响，可能是患上了慢性喉炎、慢性咽炎、扁桃体炎等疾病，可以在明确诊断后，在医生指导下通过增强抵抗力、使用药物等方式进行治疗。
1.慢性喉炎
慢性喉炎是由于过敏、咽喉损伤等原因导致的一种咽喉疾病，常表现为声音嘶哑、咳嗽、喉痛。所以睡醒就咳嗽可能是慢性喉炎导致的。患有慢性喉炎要多喝水，少吃辛辣刺激食物，减少对喉咙的刺激，也可以在医生的指导下使用孢地尼分散片，头孢克肟胶囊等药物治疗。
2.慢性咽炎
慢性咽炎是一种位于咽部黏膜、黏膜下及淋巴组织的慢性炎症，慢性咽炎发病一般和不良生活习惯、粉尘刺激有关。患者常有喉咙干痒、咳嗽的症状，所以睡醒就咳嗽可能是患有慢性咽炎。患者可通过坚持运动来提高免疫力，进而在一定程度上缓解症状，也可遵循医嘱使用复方硼砂溶液、呋喃西林溶液治疗。
3.扁桃体炎
扁桃体炎是于致病微生物感染、免疫力下降有关的一种呼吸道疾病，常表现为咽部疼痛、有异物感、咳嗽，可能出现睡醒就咳嗽现象。患者应当前往医院，在医生的指导下通过应用复方硼砂溶液、复方氯己定含激液等药物治疗。