做完核酸之后嗓子不舒服，主要是因为在采样过程中咽拭子对喉咙的摩擦使咽喉黏膜受到损害引起的，另外患有慢性咽炎的患者也较为容易在核酸后出现嗓子不舒服的现象。
1.咽喉黏膜受损
核酸检测一般需要医生用咽拭子对受检者的鼻腔或喉咙扁桃体处进行多次摩擦，进行分泌物的采集，若是从喉咙处进行采集，受检者不够配合头部左右晃动或者医护人员动作不够轻柔都有可能造成被检者咽喉部黏膜受损，出现嗓子不舒服的现象。
2.慢性咽炎
核酸后嗓子不舒服的现象一般会在几天后自行治愈，不必过于紧张。对于极个别咽喉部位较为脆弱的患者，嗓子不舒服可能是因为核酸后咽喉黏膜受损导致了炎症出现，表现为咽喉部位红肿疼痛，可在医生指导下进行相应治疗。慢性咽炎患者大多有咽反射敏感，若检查时医护人员动作不够快，容易刺激患者咽部，造成做完核酸后嗓子不舒服。