目前临床是没有用于治疗HPV的特效药的，所以会出现使用三个月干扰素HPV16还是阳性的情况。在治疗期间不能进行性生活，平时注意个人私密卫生，并且要作息规律、坚持运动来增加身体的免疫力，因为HPV主要靠自身的免疫力清除病毒。建议及时接种宫颈癌疫苗，每年定期体检，异常及时治疗。
HPV16型属于宫颈病变高危型，需要做阴道镜下活检+TCT（宫颈细胞学检查）进一步来检查是否有宫颈病变，如果有宫颈病变，需要根据报告来决定是否需要做宫颈锥切。如果阴道镜检查报告是正常的，建议分别在阴道镜检查后的三个月、半年、一年给予复查HPV和宫颈TCT，再根据报告决定后续处理。目前研究发现80％的女性在性活跃期间都会感染HPV病毒，但大部分都属于一过性感染，其中90％-95％会在8-13个月被自身的免疫清除。