通常下午肚子总是咕咕叫可能是由于急性胃肠炎、慢性胃炎等原因导致，可以通过应用药物、手术等方式进行治疗。
1.急性胃肠炎
细菌感染、自身免疫低下等原因都可能会导致急性胃肠炎的出现，该类疾病会出现肠鸣音、腹痛等症状。所以会出现下午肚子总是咕咕叫的现象，可以在医生的指导下使用抗感染类药物比如环丙沙星、左氧氟沙星等药物进行治疗。
2.慢性胃炎
是一种多种原因引起的胃部黏膜损伤疾病，治疗时间相对较长。临床症状包括腹痛、反酸等，部分患者可能还伴有肠鸣音亢进、呕血等症状。所以会出现下午肚子总是咕咕叫的现象，可根据医嘱应用抗感染类药物比如克拉霉素、阿莫西林等药物进行治疗。病情严重时可以采用内镜黏膜下剥离术等方式进行治疗。