轮状病毒发烧39度（℃）首先需要在医生指导下应用退热药物，常用的退热药物主要有布洛芬、对乙酰氨基酚等，并且服用退热药物后及时就医对因治疗。感染轮状病毒除了会引起患者发烧之外，还可以出现呕吐、腹痛、腹泻等情况，可以在医生指导下应用蒙脱石散、双歧杆菌等药物止泻，也可以口服补液盐或者静脉输液预防水电解质紊乱。
患者在治疗期间应注意防寒保暖，防止受凉导致症状进一步加重，饮食方面宜清淡易消化，不可食用生冷、辛辣等刺激性食物，避免加重胃肠负担。同时患者需要严格遵照医嘱规律用药，多卧床休息，保持个人清洁卫生，饭前便后勤洗手，适当进行体育锻炼提高机体的抵抗能力。