一般情况下，气管含气囊肿是不能自愈的。气管含气囊肿通常指的是气管右侧的囊肿，并与气管相通，里面含有气体，常伴随咳嗽、咳痰等症状，是一种先天性异常所导致的疾病，因此气管含气囊肿不能自愈。
若气管含气囊肿比较小，不会对气道造成压迫且患者没有任何的临床表现，则不需要特殊处理，按时复诊即可。若气囊肿较大，对气管造成压迫，并且经常咳嗽，甚至有明显的呼吸困难、胸闷等症状，可通过支气管囊肿手术进行切除。术后应当清淡饮食，每天保证摄入定量的蛋白质和维生素，且一定要坚持低盐、低糖、低脂肪的饮食习惯，切忌暴饮暴食，避免辛辣刺激的食物，坚持适量的体育锻炼。