一般情况下，舌根部不舒服的原因通常有舌咽神经痛、慢性咽炎等，建议患者及时就医对症治疗，可以通过应用药物或者调整饮食等方面来进行治疗。
1.舌咽神经痛
舌咽神经受到了一定的刺激之后容易引起舌咽神经痛，比如大笑、喝冷饮、打喷嚏、打哈欠、等动作都有可能刺激到舌咽神经。舌咽神经痛患者通常会表现出扁桃体区、舌根部、咽喉部等出现阵痛，所以会有舌根部不舒服的情况。患者可以在医生的指导下应用卡马西平、巴氯芬等药物来进行治疗。
2.慢性咽炎
通常是由于长期吸烟喝酒、误吸入刺激性气体以及食用辛辣油腻类的食物而导致，患者通常会出现咽喉部干燥、咳嗽、咽部瘙痒，也会出现舌根部不舒服的情况。患者需要调整自己的饮食结构，食用一些清淡易于消化的食物，多吃一些富含维生素的水果以及蔬菜，日常多饮水来缓解咽部的不适症状。也可以在医生的指导下使用呋喃西林溶液、复方氯己定含漱液等药物进行缓解。