牛黄上清丸主要用于清火止痛，部分患者服用后会有肠胃道不适，如腹痛、腹泻等，少数患者会出现皮疹等过敏反应。建议服药后时刻关注自身情况，如有不舒服现象发生，应及时向医师反馈。
牛黄上清丸由人工牛黄、薄荷、菊花、白芷、栀子、连翘、当归、冰片等组成，是清热泻火剂，能够清热散风，泻火止痛，主要治疗由热毒内盛、风火上攻引起的目赤耳鸣、牙龈肿痛、咽喉肿痛、头痛晕眩等病症。
牛黄上清丸药性较寒凉，建议饭后服用，以免损伤脾胃。服药期间不宜同时服用温补性药物，如健脾丸、金匮肾气丸等。肝病、肾病等慢性病患者、孕妇、脾虚便溏者及小孩，应在医师指导下服用。服药三天后若症状无改善，建议去医院就诊，以免耽误病情。