通常情况下，尿道里有小颗粒可能是由于尖锐湿疣、尿道炎症导致的，患者一般可以通过手术、应用药物等方式进行处理。
1.尖锐湿疣
一般免疫力低下，不洁性行为等等都有可能导致尖锐湿疣病症的出现，患者在患病后通常会出现生殖器溃烂、出血、全身发热、生殖器周围小颗粒状赘生物等症状，所以尿道里有小颗粒可能是由于尖锐湿疣导致的，建议患者可以到正规的医院进行激光、冷冻、手术等方式进行处理，同时建议患者注意个人卫生，避免传染给身体的其他部位，避免与配偶及其他人发生性行为，多吃富含维生素的蔬菜水果，提高自身免疫力。
2.尿道炎
通常尿道炎是由于妇科炎症、细菌感染导致的，通常可表现为尿道口流脓、尿道存在小颗粒等等，通常建议患者可以在医生的指导下使用头孢克洛、阿莫西林等药物进行处理，同时建议患者穿舒适的内衣裤，保证充足的睡眠。