流产第三天轻微肚子疼正常，是由于子宫在自我恢复过程中收缩引起的。若有较严重的肚子疼，首先考虑与宫腔感染、流产不全等情况有关，建议患者可前往妇科进行就诊，根据不同症状以及临床表现进行相关的治疗。如患者流产时孕周较大，出现肚子疼症状正常不需要进行特殊治疗。建议患者在日常生活中日，卧床休息、增强体质，避免劳累、清淡饮食。多吃富含维生素的新鲜水果和蔬菜。预防感冒，减少外出在污染较重的时候可选择佩戴口罩防止吸入刺激性或有害气体或颗粒，注意保暖，及时增添衣物。如有异常症状，及时就医。
1、宫腔感染：由于宫腔操作过程中违规操作或有细菌感染所引起的。建议患者以抗炎治疗为主，在医生指导下选择敏感的抗生素抗炎治疗，治疗药物如甲硝唑、阿莫西林等消炎药物进行治疗。
2、流产不全：在操作过程中，流产不干净所导致的患者出现肚子疼，阴道不规则流血等情况，如患者残留物较少可遵医嘱服用药物促进残留排出，若残留物较大则需要在医生的指导下再次清宫。