长效避孕药和短期的相比对身体伤害大在于胃肠道、内分泌，心血管等方面，患者可表现为经期紊乱、闭经、动脉硬化、心肌梗死等的病发率。短效避孕药激素含量最小，如果只是偶尔服用，通常对患者身体影响不大，如果长期使用，可能会导致女性月经紊乱、闭经。两种药物的区别在于避孕时间的长短，药物服药的时间，副作用等都不同。建议患者在医生的指导下进行服用避孕药。建议患者不要过度依赖药物避孕的方法，也可采取其他形式的方式进行避孕，如避孕套，宫内节育器、手术结扎等方式。
1、长效避孕药：需要长期服药，药物的副作用也较大，常见的表现有经期延长，不规则阴道流血等。不可自行停药，建议在医生的指导下进行换药或停药，使体内激素水平缓慢下降，避免不良反应。
2、短效避孕药：需要连续服药，每天服用，不能漏服，一个周期后停药。不良反应可表现为恶心、呕吐、乏力、头晕等反应，一般不需特殊处理，症状自行缓解。