一般情况下，软镜碎肾结石能否排干净与术后的调理有关，需要听从医生建议改善生活习惯，可以达到较好的治疗效果。但是软镜碎石也有一定的副作用，例如碎石可能发生感染的传播、具有结石残余等情况，这时需要及时前往医院进行检查，根据医生建议，采取进一步的治疗手段，以免造成病情加重。
当结石硬度较高、体积较大、发生结石位置不适于体外冲击波碎石手术时，可能会采用软镜碎石的方式，将软镜从尿道插入到肾盂中，采用激光碎石。需要注意的是，在进行手术后多进行休息，不要剧烈运动，不要熬夜，保证睡眠时间和睡眠质量，多喝水，不要暴饮暴食，合理调整膳食结构，不要吃高嘌呤、高胆固醇、高蛋白的食物，避免吸烟饮酒，经过合理的调养，碎石是能够排干净的。