通常情况下，排尿时龟头部尿道疼痛，可能是由于前列腺炎、包皮过长等引起的，患者可以通过应用药物、手术等方式进行治疗。
1、前列腺炎
前列腺炎通常是由于致病菌病原体感染引起的，常伴有排尿刺痛、外生殖器不适等症状，因此前列腺炎可能会导致患者排尿时龟头部尿道疼痛。患者应该及时前往医院，在医生的指导下应用药物，如环丙沙星、氧氟沙星等进行治疗。此外患者也可以采取按摩、物理治疗如微波、激光等方式进行治疗。患者在日常生活中，应该注意私处清洁卫生，养成良好的性生活习惯。
2、包皮过长
包皮过长通常是由于遗传、发育异常等引起的，可能会产生包皮垢，从而产生异味、尿道刺痛等症状，因此可能会导致排尿时龟头部尿道疼痛。患者应该及时前往医院，在医生的指导下进行手术治疗，将过长的包皮切除。患者在日常生活中，应该注意生殖器清洁。