氨苄西林与阿莫西林药效具有一定的差别。两者同属青霉素类抗生素，不过阿莫西林药效稍好于氨苄西林。除了杀菌作用更强，穿透细胞膜的能力也强于氨苄西林，是目前应用较为广泛的药。氨苄西林是一种内酰胺类抗生素，可治疗多种细菌感染，主要适用于呼吸道感染以及泌尿系统感染。
阿莫西林是半合成青霉素类，相比于氨苄西林，在结构上多出一个羟基，具有更强的耐受性和抗菌性。而且酸性条件下阿莫西林相对来说更加稳定，胃肠道对阿莫西林的吸收率有90%，高于氨苄西林。两者具有相似的药理和适应症，适应各种β-内酰胺类抗生素敏感菌引起的炎症，如呼吸道感染，生殖泌尿系统感染等症状。在用药的同时，建议减少辛辣、刺激、甜腻食品如辣椒、肥肉等摄入，多吃水果蔬菜，避免长时间、高压力工作和熬夜，并且注意面部皮肤清洁、保湿和减少皮脂分泌，保持心情愉悦。