艾滋病患者会咳嗽是因为艾滋病患者机体的免疫功能较低，防御功能也较差，呼吸系统易受到细菌等致病微生物的入侵而出现感染，所以会出现咳嗽，严重的患者还会出现咳痰、咳血、胸闷、胸痛和呼吸困难等其他呼吸系统的症状。
1、艾滋病患者如果出现一直咳嗽，有可能是发生了肺部感染，比较常见的病原菌有肺孢子菌、结核杆菌等。此时要去医院进行血常规、胸部CT、痰涂片、痰培养等相关的检查，并尽快针对病原菌进行相应的抗感染治疗。此外，还要对患者进行相应的抗病毒治疗，可以通过使用拉米夫定、阿巴卡韦等抗病毒药物抑制HIV病毒的复制，使患者免疫功能逐渐的恢复，避免反复发生感染.
2、如果患者咳嗽还伴有有痰咳不出的现象，需要观察患者是否还有发热的症状，并且咳嗽是否累及下呼吸道，通常需要进行肺部CT检查进行判断。如果检查发现肺部CT提示有炎症，需要尽快进行病原治疗，可以选择复方磺胺甲恶唑等药物；如果肺部CT提示结核病变，需要考虑抗结核治疗。另外，还要进行巨细胞抗体检测判断是否有巨细胞感染，如果合并有巨细胞感染，可以选择更昔洛韦或者膦甲酸钠抗巨细胞治疗。