角膜反射可以受到多种病变的影响。 角膜反射消失常见有以下三种情况：
(1)反射弧传入神经病变：三叉神经眼支的病变，除了面部该支的分布区(前额部皮肤)有感觉障碍外，同时伴有角膜反射减弱或消失。该侧三叉神经损害造成角膜麻痹时，双侧均无反应，而在作对侧角膜反射时仍可引起双侧反应。角膜反射减弱常见的原因是三叉神经第一支 损害的早期症状，随着病变的发展，而终至角膜反射消失。由于小脑幕也使由三叉神经第一支分布，在颅后窝病变时，早期可出现角膜反射减弱，如小脑出血、桥脑小脑角胆脂瘤等。有人报道同侧角膜反射减弱和/或消失，是定位诊断的重要指证。
(2)角膜反射的传出神经病变(周围性面神经麻痹)：角膜反射的传出神经为面神经，当周围性面神经病变时，角膜受到刺激后不能闭目(瞬目)，出现此种现象从广义来看，也属角膜反射消失。该侧面神经麻痹时，同侧角膜反射消失而对侧反射存在。
(3)一侧大脑半球病变：单侧角膜反射减弱或消失，常为偏身麻木的一部分，而在不少偏瘫病例中，角膜可能是唯一的麻木区域。有人认为，在顶叶有角膜反射中枢，或许可以得以解释。如果双侧角膜反射减弱或消失时，说明大脑两侧有广泛性损害(如在深昏迷、脑水肿、脑缺氧)，侵犯了角膜反射的脑内反射弧。
另外，三叉神经受损也会是角膜反射消失。
